自101年9月6日起行政訴訟由原來二級二審制，改採三級二審制，全國各地方法院已設立行政訴訟庭，審理簡易訴訟程序事件第一審事實審案件。而稅務案件訴訟標的金額在新臺幣（下同）40萬元以下者屬簡易訴訟程序事件。
該局說明：納稅義務人如對該局核定稅捐處分不服，申經復查及訴願均遭駁回後，提起行政訴訟，如訴訟標的金額在40萬元以下適用簡易訴訟程序事件，原制直接由高等行政法院審理後以最高行政法院終審，新制改由地方法院行政訴訟庭審理後以高等行政法院為終審；至金額逾40萬元則適用通常訴訟程序事件，仍維持由臺北高等行政法院審理。
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