財政部臺北國稅局表示，營業人之進項稅額准予扣抵或退還，應以「已申報者」為前提，並非所取得進項憑證均得扣抵。

該局舉例說明，甲君於103年9月至104年3月間於拍賣網站銷售貨物，漏開統一發票並漏報銷售額，經該局查獲，核定補徵營業稅並處罰鍰。甲君不服，主張其進口商品於進口時已由海關代徵營業稅，自應先扣減該代徵營業稅款，再行核定補徵營業稅及衍生之罰鍰，始為公平云云。

該局指出，按加值型及非加值型營業稅法（下稱營業稅法）第15條第1項規定當期銷項稅額得扣減之「進項稅額」，係依法登記之營業人取得同法第33條所列之合法要式憑證，且於申報期限內檢附向主管稽徵機關申報扣減，而據以計算當期應納或溢付營業稅額為前提要件，參諸司法院釋字第660號解釋及營業稅法規定自明，故甲君未依規定申請營業登記，而以「自然人」名義於進口時繳納之營業稅額，核與上揭規定不符，自不得主張扣減。是甲君主張原核定營業稅額時，應予扣除於進口時已由海關代徵營業稅，核無足採，駁回其復查申請。

該局指出，依營業稅法第35條第1項規定，營業人不論有無銷售額，應按期填具申報書，檢附退抵稅款及其他有關文件，向主管稽徵機關申報銷售額、應納或溢付營業稅額。準此，營業人之進項稅額准予扣抵或退還，應以已申報者為前提，故營業人違反營業稅法第51條第1款至第4款及第6款，據以處罰之案件，營業人如於經查獲後始提出合法進項憑證者，稽徵機關於計算漏稅額時，應否准其扣抵銷項稅額。

該局提醒，營業人若對其是否為營業人，應否向主管稽徵機關辦理營業登記、開立統一發票並申報銷售額等情，可主動向主管稽徵機關或相關專業人員查詢，以免遭補稅處罰，得不償失。

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