該局舉例說明，總機構在中華民國境外之A公司於102年間以新臺幣（下同）3,000萬元100%投資持有中華民國境內乙筆房地之境外B公司，嗣A公司因基於投資風險之考量，於106年1月1日（股權移轉登記日）以7,000萬元將所持有B公司全部股權出售予D公司，由於A公司持有B公司股權比例超過50%以上，且交易時B公司持有之中華民國境內房地價值4,200萬元占B公司股權價值比例亦超過50%以上（4,200/7,000=60%>50%），故A公司106年股權交易所得之應納稅額為1,400萬元【（7,000-3,000）×35%=1,400】
該局呼籲，為配合房地合一課徵所得稅制度的重大改革，財政部已於104年7月21日發布房地合一課徵所得稅申報作業要點，營利事業應特別注意相關法令規範內容及備妥應檢附之證明文件，以維護自身權益，亦可避免因疏忽而短漏報所得受罰，得不償失。
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