該局舉例說明，轄內甲公司辦理101年度營利事業所得稅結算申報，列報銷貨折讓8千餘萬元，經該局以其列報銷貨折讓較以往年度偏高，顯為異常，經查核該公司提示之文件，未載明相關銷貨折讓之原因、金額及方式等約定，又查得甲公司係於事後才協議調減當年度銷貨收入，乃遭剔除補稅。甲公司不服，主張其給與銷貨折讓後，申報之所得額仍達財政部頒訂之同業利潤標準，該局逕予調整，顯侵害其營業自由等語，申請復查，未獲變更，循序提起訴願及行政訴訟，全案經高等行政法院判決駁回確定。
該判決指出，我國所得稅制係採申報制，其核心價值之一，即由納稅義務人秉持誠實精神主動申報完稅，故納稅義務人倘有匿報、短報或漏報等情事，則其偏離所得稅制之核心價值，為法所不許，準此，縱納稅義務人申報之所得額在該業所得額標準之上，惟經發現有匿報、短報或漏報所得額之情事，稅捐稽徵機關仍得依所得稅法及稅捐稽徵法等相關規定，調查課稅資料，予以補徵或裁罰。
該局特別提醒，營利事業申報之所得額雖達財政部頒訂之同業利潤標準，仍應負誠實申報之義務，以免遭補稅或處罰。
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