該局表示，依據所得稅法第39條規定，適用以往年度虧損扣除之條件包括：1.公司組織。2.會計帳冊簿據完備。3.虧損及申報扣除年度均使用藍色申報書或經會計師查核簽證。4.如期申報。
該局舉例，甲公司104年度營利事業所得稅結算申報案件，原申報全年所得額新臺幣(下同)1,000萬元，並以103年度虧損數扣除，申報課稅所得額為0元。經查核發現甲公司與A公司進貨交易500萬元，卻取得B公司開立之發票，雖不影響全年所得額，然而甲公司未依規定取得交易相對人進貨發票金額為500萬元，已超過新臺幣120萬元，且超過同年度進貨、費用或損失依規定應取具憑證金額4,500萬元（含此筆500萬元）之10%，依照財政部101年1月30日台財稅字第10000457660號令規定，不符合情節輕微，認屬會計帳冊簿據不完備，遭該局否准適用盈虧互抵，補徵稅額170萬元。
該局呼籲營利事業之進貨、費用及損失，務請依規定取得交易相對人之憑證，以免不符會計帳冊簿據完備之規定，影響適用盈虧互抵之權益。
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