該局表示，常見營利事業因同一年度承包多項長期工程，雖有編製成本總報表，惟未分別按不同工程計算入帳及編製各項工程成本報表，甚至無法提示工程合約，或是提供之工程合約與工程成本無法勾稽查核，導致各項工程成本混淆不清，又因無法提示工程驗收證明及相關進料、領、退料、工時與工作紀錄之施工日報表，致無法查帳核定其當年度所得額，被依同業利潤標準核定。
該局進一步說明，所得稅法第83條第1項規定，稽徵機關進行調查或復查時，納稅義務人應提示有關各種證明所得額之帳簿、文據；其未提示者，稽徵機關得依查得之資料或同業利潤標準，核定其所得額。另同法施行細則第81條所稱之帳簿文據，其關係所得額之一部或關係課稅年度中某一期間之所得額，而納稅義務人未能提示者，稽徵機關得就該部分依查得資料或同業利潤標準核定其所得額。
該局提醒營利事業，如同一年度承包多項長期工程，其工程成本應確實依各工程分別計算，並於國稅局調查時，提示相關證明所得額之帳簿文據供查，以維護自身權益。
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