國稅局表示：營利事業、教育、文化、公益、慈善機關或團體屬應辦理109年度營利事業所得稅結算、決算或清算申報者，其員工經衛生機關通知應居家隔離(檢疫)，或員工因照顧應居家隔離(檢疫)之家屬而請防疫隔離假者，得就其給付該員工請假期間薪資金額之百分之二百，自當年度營利事業所得額減除，並以計算所得額至零為限。所需證明文件為給付該員工薪資證明、員工請防疫隔離假之假單、請假紀錄及員工(或受隔離檢疫家屬)經衛生主管機關開立之居家隔離(檢疫)通知書、集中隔離(檢疫)等證明文件。
該局並提醒營利事業給付請防疫隔離假員工請假期間之薪資費用應減除政府補助款後之餘額，始可加倍減除。應注意的是，營利事業給付該員工請假期間之薪資金額如已適用其他法律規定之租稅優惠，或營利事業依所得稅法第24條規定計算之所得額已為負數者，不適用薪資費用加倍減除之規定。
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