該局說明，依加值型及非加值型營業稅法第19條規定，購買非供本業及附屬業務使用之貨物或勞務所支付之進項稅額，不得申報扣抵銷項稅額，但為協助國防建設、慰勞軍隊及對政府捐獻者，不在此限。又依所得稅法第36條規定，營利事業為協助國防建設、慰勞軍隊、對各級政府之捐贈，以及經財政部專案核准之捐贈，於辦理營利事業所得稅結算申報時得全額認列費用，不受金額限制；但如係對合於所得稅法第11條第4項規定之教育、文化、公益、慈善機關或團體之捐贈，則得認列費用之金額以不超過所得額10%為限。
該局舉例說明，A公司110年度購買20萬元及30萬元之防疫物資分別捐贈與甲公立醫院及財團法人乙醫院，因對甲公立醫院之捐贈20萬元屬對政府之捐贈，其購買防疫物資所支付之進項稅額得扣抵銷項稅額，且於營利事業所得稅申報時得全額認列捐贈費用，不受金額限制；而對財團法人乙醫院之捐贈30萬元，因非屬對政府之捐贈，其購買防疫物資所支付之進項稅額不得申報扣抵銷項稅額，至於營利事業所得稅申報，因乙醫院為合於所得稅法第11條第4項規定之團體，A公司得列報之捐贈費用以不超過所得額10%為限。
該局呼籲，營利事業捐贈防疫物資，除注意營利事業所得稅捐贈費用限額之規定外，亦應檢視統一發票之扣抵情形，如有發現不合，依稅捐稽徵法第48條之1規定，只要在未經檢舉、未經稽徵機關或財政部指定之調查人員進行調查前，自動補報並補繳所漏稅款，可加息免罰。
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